Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vps13cQ8BX70 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps13cQ8BX70 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms