Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slx1bQ8BX32 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slx1bQ8BX32 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slx1bQ8BX32 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms