Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ube3dQ8BX13 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube3dQ8BX13 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms