Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Zcchc4Q8BKW4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Zcchc4Q8BKW4 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms