Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gpc2Q8BKV1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gpc2Q8BKV1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms