Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gabra5Q8BHJ7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gabra5Q8BHJ7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms