Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Vipas39Q8BGQ1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Vipas39Q8BGQ1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Vipas39Q8BGQ1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Vipas39Q8BGQ1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vipas39Q8BGQ1 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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Vipas39Q8BGQ1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Vipas39Q8BGQ1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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Vipas39Q8BGQ1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vipas39Q8BGQ1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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