Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Srgap3Q812A2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Srgap3Q812A2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms