Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Atg4cQ811C2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Atg4cQ811C2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Atg4cQ811C2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Atg4cQ811C2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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