Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem39bQ810L4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem39bQ810L4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem39bQ810L4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms