Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZS5

Cldn34b3, Claudin 34B3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b3Q80ZS5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cldn34b3Q80ZS5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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