Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbbp8Q80YR6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms