Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Kdm5bQ80Y84 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Kdm5bQ80Y84 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms