Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nrde2Q80XC6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nrde2Q80XC6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms