Protein–RNA interactions for Protein: Q80WJ6

Abcc12, Multidrug resistance-associated protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc12Q80WJ6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Abcc12Q80WJ6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Abcc12Q80WJ6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms