Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc1Q80VQ1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms