Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ttc29Q80VM3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ttc29Q80VM3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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