Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nup214Q80U93 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nup214Q80U93 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms