Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Avl9Q80U56 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Avl9Q80U56 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms