Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clec18aQ7TSQ1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Clec18aQ7TSQ1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clec18aQ7TSQ1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms