Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ppp6r1Q7TSI3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ppp6r1Q7TSI3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms