Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nek5Q7TSC3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nek5Q7TSC3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms