Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RgmbQ7TQ33 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RgmbQ7TQ33 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms