Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Prrc2bQ7TPM1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Prrc2bQ7TPM1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms