Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD6

Raver2, Ribonucleoprotein PTB-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raver2Q7TPD6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Raver2Q7TPD6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Raver2Q7TPD6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms