Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sbno2Q7TNB8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sbno2Q7TNB8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms