Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SyncripQ7TMK9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SyncripQ7TMK9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms