Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Smim12Q78RX3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Smim12Q78RX3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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