Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmed3Q78IS1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmed3Q78IS1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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