Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nme8Q715T0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nme8Q715T0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms