Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rps27Q6ZWU9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rps27Q6ZWU9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms