Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ppp2r2bQ6ZWR4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppp2r2bQ6ZWR4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms