Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Topbp1Q6ZQF0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms