Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nemp1Q6ZQE4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nemp1Q6ZQE4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms