Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Larp1Q6ZQ58 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Larp1Q6ZQ58 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms