Protein–RNA interactions for Protein: Q6XP49

Glis3, Zinc finger protein GLIS3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Glis3Q6XP49 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Glis3Q6XP49 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Glis3Q6XP49 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Glis3Q6XP49 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Glis3Q6XP49 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Glis3Q6XP49 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Glis3Q6XP49 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Glis3Q6XP49 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Glis3Q6XP49 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Glis3Q6XP49 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Glis3Q6XP49 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Glis3Q6XP49 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Glis3Q6XP49 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Glis3Q6XP49 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms