Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slc44a1Q6X893 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc44a1Q6X893 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms