Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Rhox8Q6VSS7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Rhox8Q6VSS7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Rhox8Q6VSS7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms