Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc57Q6PHN1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc57Q6PHN1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms