Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc82Q6PG04 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc82Q6PG04 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms