Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim45Q6PFY8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim45Q6PFY8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim45Q6PFY8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim45Q6PFY8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trim45Q6PFY8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trim45Q6PFY8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms