Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rad54bQ6PFE3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rad54bQ6PFE3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms