Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM8

Slc46a1, Proton-coupled folate transporter, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a1Q6PEM8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slc46a1Q6PEM8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc46a1Q6PEM8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms