Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vstm2lQ6PDS0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Vstm2lQ6PDS0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Vstm2lQ6PDS0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vstm2lQ6PDS0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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