Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SvoplQ6PDF3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SvoplQ6PDF3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms