Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg2aQ6P4T0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg2aQ6P4T0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms