Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RbfaQ6P3B9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RbfaQ6P3B9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.1 ms