Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PrimpolQ6P1E7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PrimpolQ6P1E7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms