Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HelbQ6NVF4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HelbQ6NVF4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms