Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fbxo41Q6NS60 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Fbxo41Q6NS60 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms